《主君惊惧手游》中的每位玩家都可以加入军团，参加各种挑战活动。我们可以在活动列表中看到军团副本活动。这项活动每周末开始。军团中的每个玩家每个玩家都可以参加副本进行挑战。挑战成功后，可以获得相当丰厚的奖励。每周有两次挑战机会。当然，具体开放时间段由领队决定。如果你决定的话，可以选择在军团在线人数最多的时候开启，并且可以自由选择难度。可以根据军团成员的整体战斗力进行调整。这个设定可以说是相当贴心了。目前的挑战分为普通和困难两种难度。不过，要开启困难难度，军团需要先通关普通难度。
在军团副本中，我们需要挑战各种NPC军队。当敌人进攻时，我们要保卫自己的大本营，同时也要攻击敌人的大本营。如果我们想赢得战斗，就需要在规定的时间内击败敌人。摧毁大本营才能取得最后的胜利。每次的时间限制是15分钟，可以说是相当紧急了。需要各种输出职业的合理组合，才能最大化输出。可以更有效地摧毁敌人及其基地。
不同的NPC也以品质来区分。从低到高分别是白、绿、蓝、紫、橙、红。 NPC的品质越高，属性就越好。这会给我们带来更高的挑战难度，尤其是淘汰。使用红将时需要特别注意。
